يهدف هذا القسم إلى الارتقاء بقطاع الصناعة من خلال الابحاث والمشاريع فى مجالات كيمياء وتكنولوجيا الزيوت والدهون ومشتقاتها والنواتج الثانوية للبذور الزيتية ومن مهام القسم:-
1. إستخدام تكنولوجيا و تطبيقات النانو فى مجال الزيوت و الدهون و مشتقاتها.
2. إنتاج مركبات كيميائية ذات أساس دهنى (oleochemicals) من الزيوت والدهون والأحماض الدهنية المستخلصة منها و من البذور الزيتية و مخلفات تصنيعها لاستخدامها كمواد وسيطة فى الصناعات الغذائية والكيماوية والدوائية والمنظفات والصابون وخلافه.
3. التقييم الكيميائى و التكنولوجى و البيولوجى للبذور الزيتية و منتجاتها (الزيت والكسب و مستخلصاتها الأخرى) ووسائل تحسين جودتها و جودة منتجاتها كما و نوعا.
4. إستغلال المخلفات و المواد الثانوية الناتجة من تصنيع الزيوت الغذائية لانتاج مركبات على درجة عالية من الأهمية الغذائية و الغير غذائية و الإقتصادية.
5. تصنيع بدائل للزيوت و الدهون لها نفس الصفات الطبيعية و الكيميائية للزيوت والدهون و لكنها منخفضة فى محتواها من الطاقة.
6. إستخدام مستخلصات مضادات الأكسدة الطبيعية لتحسين ثبات الزيوت ضد الأكسدة و التزنخ.
7. تصنيع المنتجات الدهنية الخالية من الأحماض الدهنية العكسية.
8. الإستغلال الأمثل لبروتينات البذور الزيتية لتحضير منتجات بروتينية غذائية وعلاجية.
9. تحضير مركبات ذات نشاط حيوى من النواتج الثانوية للبذور الزيتية واستخدامها كمضادات أكسدة و مضادات ميكروبية و سرطانية.
10. تحضير بعض الحلقيات غير المتجانسة المشتقة من الدهن وتتسم بخواص بيولوجية.
11. إنتاج وقود حيوى (لمحركات الديزل والطائرات) من الزيوت المستهلكة وغير الغذائية.