السموم الفطرية هي عائلة من المركبات البيولوجية و التي تنتجها مجموعة من الفطريات لها القدرة على إنتاج مركبات أيضية ثانوية عندما تنمو على بيئة مناسبة لها، و النواتج الأيضية الثانوية للفطريات مركبات نشطة بيولوجياً، و بالإضافة إلى ذلك، أنها سموم غير أنتيجينية بمعنى خلو تركيبها الجزيئي من المكونات التى تدفع الجسم الحي لتكوين أجسام مضادة لها، و أغلبها سام للإنسان و الحيوان و النبات و الكائنات الحية الدقيقة. و هي غالباً ما تحدث تغيرات بيولوجية غير طبيعية في الكائن الحي.

  من السموم الفطرية التي قد تتواجد في الأعلاف ما يعرف بـ الإوكراتوكسين‏،‏ الذي يوجد في الذرة الصفراء‏،‏ و ثبت أنه وراء ‏70%‏ من حالات الفشل الكلوي في مصر‏.‏ يُضاف إليه سم الافلاتوكسين الموجود في القمح و فول الصويا و الردة و هو المسؤول عن السرطان و الفشل الكلوي‏.‏ و ثمّة سم ثالث من الفطريات باسم الفيوماتثنين الذي يدمر خلايا المخ و يصيبه بالشلل‏.

  أكدت تقارير البنك الدولي لعام 1993 ان 40 % من سنوات الحياة في الدول النامية فقدت أو ضاعت نتيجة للأمراض الناجمة عن السموم الفطرية. كما أوضح تقرير الأكاديمية الدولية للعلوم بالولايات المتحدة عام 1996م بأنّ معدل السرطان بالولايات المتحدة يتأثر بالتعرض للسموم الفطرية أكثر من المبيدات.