في هذه الدراسة، تم تحليل النيوكليوتيدات و تسلسل الأحماض الأمينية للبروتين المغلف للعزلات المصرية لفيروس قصب السكرالمبرقش (ScMV-Egy) لتحديد المناطق الانتيجينة. نتج عن تحليل PCR 360 قاعدة وتمت مقارنة تتابع الحمض النووي للعزله مع عزلات من بنك الجينات، تم الكشف عن 3 طفرات رئيسية(C8822→T, G8831→T and T8846→C)  ، نتج عن احداها تحول في الحمض الاميني  (K2894→N). لوحظ أنه لا يوجد أي تأثير من الثلاث الطفرات على التركيب الثانوي للحمض الريبونووي المتنبأ به. تم التنبؤ بالمواقع الانتيجينية باستخدام تسلسل الأحماض الأمينية للعزله المصريه  والعزلات المتاحه علي بنك الجينات في جين الغلاف البروتيني. وباستخدام antigenicity، hydrophilicity، وقابلية الذوبان والتعرض للمساحة السطحية, كانت اعلى نتائج للمواقع الانتيجينية في مناطق tratreefdrw2878, ddtqmtvvmsgl2899, eefdrwyeai2883 tratree2878, tvvmsglmvwci2904 .للمزيد من التحقق من صحة التنبؤ سوف يتم اجراء تجارب عملية لاختبار فاعلية المواقع الانتيجينية المتوقعة كوسيلة لإنتاج أداة تشخيصية محددة ضد عزلات فيروس ScMV في مصر وجميع أنحاء العالم.