بدأ نشاط شعبة بحوث البيئة  فى مجال بحوث الهواء 1957 بإنشاء وحدة بحوث الطبيعه الحيويه والتى ركزت دراستها العلميه انذاك على دراسة الجسيمات العالقة والمترسبة فى هواء القاهرة  وبعد ذالك وفى عام 1964 بعد صدور القرار الجمهوري رقم 2271 الخاص باعادة التنظيم الهيكلى للمركز بدأت هذه الوحده تمارس نشاطها مجال تلوث الهواء ومنها دراسة ملوثات الهواء ببعض المناطق الصناعيه مثل منطقة حلوان.
•    فى عام 1958 بدأ العمل فى وحدة تلوث المياه وكانت تتمثل الدراسه فى ذلك الوقت فى التوصيف البكتريولوجي والكيميائي لبعض مصادر المياه السطحية والجوفيه وكذالك التوصيف الكيميائي لبعض المخلفات السائله الناتجه من عمليات الصناعه. وفى الفتره مابين عام 1965 الي عام 1975 انضم الى الوحده  عدد من الكوادر ليتم انشاء اول معمل فى جمهورية مصر العربية خاص بتلوث المياه
•    فى عام 1959 تم إنشاء وحدة طب الصناعات والتى كانت فى ذلك الوقت تتبع شعبة البحوث الطبية. وقد شاركت هذه الوحده فى العديد من الابحاث منها دراسة انتشار مرض الروماتيزم بين عمال الصناعه سنة 1961. 
•    فى عام 1978 تم اكتمال هذه الوحدات الثلاثه لتكون معا شعبة بحوث البيئة وقد تغير اسماء الوحدات السابقة الى الاسماء الحالية:
- قسم بحوث تلوث المياه
- قسم الطب البيئى والمهني (قسم طب الصناعات سابقا)
- قسم بحوث تلوث الهواء