رجح علماء متخصصون في علوم الأحياء والجيولوجيا أن أصل الحياة على كوكب الأرض بدأ في المناطق المظلمة من الكوكب، أي في قعر المحيطات أو على عمق كيلومترات تحت سطح الأرض، حيث تنشط حياة جرثومية كبيرة. ويقول روبرت هازن، المتخصص في الجيوفيزياء، والباحث في معهد كارنيجي في واشنطن إن "الحياة الجرثومية موجودة في كل مكان على كوكب الأرض، سواء على عمق سنتيمترات قليلة فقط من سطحها، أو على عمق كيلومترات عدة".

وتم العثور على دود صغير في شقوق على عمق 1300 متر عن سطح الأرض، في أحد مناجم جنوب أفريقيا، كما إن الحفر على عمق ستة كيلومترات في أحد مناجم الصين اظهر وجود كائنات حية دقيقة، بحسب هازان. غير أن أشكال الحياة الأكثر غموضا هي الفيروسات التي تعيش في قعر المحيطات، وقد تكون هذه الجراثيم ذات دور مهم في التنوع الجرثومي من خلال دخولها في جينومات الكائنات الدقيقة، وفق جون باروس أستاذ علم الأحياء البيئي في جامعة واشنطن. ويضيف أن "الأعماق السحيقة قد تكون شكلت مختبرا طبيعيا تكاثرت فيه التجارب، فتحت سطح الأرض توجد كل مقومات الحياة من الماء والجزيئات الغنية بالكربون".