يمكن تقسيم جزر البحر الاحمر الى جزر محيطية لها سمات الجزر التى تتكون فى قاع المحيط على أعماق كبيرة أزاء تراكم طفوح بركانية يعلو منسوبها الى أن يبلغ الجبال أما النوع الثانى من الجزر فهو الجزر الساحلية التى تقع  قريبة من الساحل الغربى مثل جزر سفاجا و الجفتون و شدوان و مجموعة جزر مضيق الجبال التى تقع امام الطرف الجنوبى لخليج السويس

و تنقسم الجزر المصرية بالبحر الاحمر الى قسمين :-

1-جــزر منطقة مضيق جبال عبارة عــن منطقة مستطيلة الشكل تقــريبا تكثر بها الجــزر و الشعـاب و  الحلقات المرجانية, و تمتد فيما بينها قنوات أةو ممرات ملاحية عميقة و تبلغ مساحة المنطقة 316 كيلو متر مربع بطول نحو 43 كيلو متر و متوسط عرض 30 كيلو متر, و تزداد اتساعا فى الجنوب ليصل الى نحو 65 كيلو متر و ذلك بسبب تراجع خط الشاطئ الجنوبى الشرقى لخليج السويس و تنتظـــم الجزر بمضيق جوبال فى صفوف تقع على طــول امتداد جبل الزيت و رأس جســمه , و تتأثر حــــولها الشعب المرجانية بشكل ملفت و تفصلها عن بعضها ممــرات عميقة نسبية , وتمتد بين خطى عرض 22,29 حيث تمر بمنطقة جبل الزيت و الغردقة فى شكـــل ثلاثة خطــوط فيما بين جبل الزيت و خــط عرض الغردقة, و يمتد الخطان الخارجيان فى اتجاه امتــداد محــور جبل الزيت و أهــم الجــزر بالخــط الخارجى اشرفى و قيصوم الشمالية و الجنوبية و جوبال و شاكر و شدوان و أهمــها بالخط الاوســط طويلة و أم قمر, و من جزر الخط الداخلى جزيرة غانم و جزيرة جسمه و تختلف هذه الجزر عن بعضها اختلافا كبيرا من حيث المساحة و الابعــاد و مساحة الاطــر المرجانية المحيطة و مـــن أمثلتها جزيرة الاخوان و الزبرجد

ب-الجزر الشاطئية و هى الجزر الممتدة على الساحل فى منطقة المياه الشاطئية الضحلة فى نطاق الرفرف القارى بين ساحل الغردقة حتى رأس حدربة عند نقطة الحدود مع السودان و يمكن تقسيم الجزر الشاطئية فى قطاعات الساحل الى عدة أقسام :-

-الجزر الشاطئية فيما بين الغردقة و سفاجا و يميز هذا القطاع من الساحل بوضوح النتوءات الارضيةمع ظهور عدد من الخلجان البحرية و أهم هذه النتوءات أو الرؤوس الارضية رأس أبو منقار و رأس الضبع و غيرهم ,و أهم الجزر فى هذا القطاع من الساحل .

1-جزيرة الجفتون الكبيرة و هى أكبر جزر مجموعة الجفتون و تبلغ مساحتها 18 كم2 و تمتد فى شكل طولى على مسافة نجو 11 كم من ساحل الغردقة و يبلغ طول سواحلها 34 كم بمعدل 9و1 لكل كم2 من جملة مساحتها .

2-جزيرة الجفتون الصغيرة و تبلغ مساحتها 3 كم2 و تقع الى الجنوب الشرقى من جزيرة الجفتون الكبيرة و يبدو أنهما كانتا جزيرة واحـــدة و لكن أنفصلتا بفعـل عمليات التصدع ,و يبلغ طول سواحلها 8 كم و تزداد أتساعا فى الجنوب عنه فى الشمال .

3-جزيرة ابو رماثى و هى أحدى الجزر الصخرية و تقع الى الجنوب الغربى من الجفتون الصغير بنحو 14 كم و مساحتها 2و1 كم2 بطول 2و1 و متوسط عرض 12 متر و يبلغ طول سواحلها 5و2 كم .

4-جزيرة سفاجا و تقع فى مواجهة ميناء سفاجا و تبلغ مساحتها نحو 13 كم2 يبلغ طول سواحلها نحو 35 كم و معنى ذلك أن كل كيلو متر مربع من مساحتها يقابله 7و2 كم من الساحل .

5- جزيرة أبو منقار و تقع أمام ساحل الغردقة و تبلغ مساحتها اقل من2 كم2 و هى جزيرة مستوية السطح و منخفضة المنسوب 2 متر تغطى سطحها تكوينات مرجانية و رمال عضوية .

6-جزيرة مجاويش تبلغ مساحتها 40 الف متر مربع و يتميز سطحها بالانخفاض و يظهر أجمالى طول سواحلها اقل من كيلو متر واحد و يوجد جزر آخرى مثل جزيرة طوبى و أم الجرصان .