(تأسس سنة 1950م)يعد مركز بحوث الصحراء بيت الخبرة الاول فى الوطن العربى والشرق الاوسط فى مجالات العمل المختلفة فى المناطق الصحراوية ومناطق الاستصلاح الحديث فهو اول مركز بحثى علمى أنشأ فى مصر . ويتميز خبراء مركز بحوث الصحراء فى النواحى العلمية والتطبيقية والارشادية فى جميع مايتعلق بالزراعة والمياه والانتاج الحيوانى تحت الظروف الجافة وشبة الجافة.

يضم مركز بحوث الصحراء الشعب البحثية التالية:
1-شعبة مصادر المياه والاراضى الصحراوية
وتشمل الاقسام التالية
قسم الجيولوجيا – قسم الاستكشاف الجيوفيزائى – قسم استخدام الطاقة المتجددة – قسم الهيدرولوجيا- قسم الهيدروجيو كيماء.
قسم كيمياء وطبيعة الاراضى – قسم البيدولوجى – قسم خصوبة الاراضى والميكربيولوجيا – قسم صيانة الاراضى.

2-شعبة البيئة وزراعات المناطق الجافة:
وتشمل الاقسام التالية
قسم الاصول الوراثية – قسم الانتاج النباتى – قسم البيئة والمراعى – قسم تثبيت الكثبان الرملية – قسم النباتات الطبية والعطرية – قسم وقاية النبات.

3- شعبة الانتاج الحيوانى:
وتشمل الاقسام التالية
قسم تربية الحيوان والدواجن – قسم صحة الحيوان – قسم انتاج وتكنولوجيا الصوف – قسم تغذية الحيوات والدواجن – قسم فسيولوجيا الحيوان والدواجن.

4- شعبة الدراسات الاقتصادية وتىجتماعية:
وتشمل الاقسام التالية
قسم الدراسات الاقتصادية – قسم الدراسات الانسانية– قسم الارشاد – قسم الاجتماع.

ويضم المركز محطات بحثية فى جميع انحاء الجمهورية :
1- محطات بحوث سبناء
محطة بحوث الشيخ زويد – محطة بحوث رأس سدر – محطة بحوث المغارة
2-الاسكندرية
محطة بحوث مريوط
3- الساحل الشمالى
محطة مرسى مطروح – محطة بحوث سيدى برانى – بالاضافة الى محطة بحوث سيوة .
4- محطات بحوث الجنوب
محطة بحوث حلايب وشلاتين – محطة بحوث توشكى .
وتبلغ الاراضى الصحراوية حوالى 96% من المساحة الكلية لمصر لذا يلعب مركز بحوث الصحراء الدور الاساسى فى تنمية الاراضى الصحراوية،
بالاضافة الى الخدمات العديدة التى يقدمها المركز لمزارعى الصحراء والتى منها على سبيل المثال :
استكشاف المياه الجوفية وحفر وتصميم الآبار طبقا للاصول العلمية - اقامة نظم مثلى لحصد وتجميع مياه الامطار – صيانة موارد المياه والتربة من التلوث - انتاج الاسمدة الحيوية للانواع النباتية المختلفة – اجراء التحليلات للاراضى والمياه والنبات والاعلاف الحيوانية – تقديم التوصيات السمادية التى تناسب الاراضى والنبات – وضع برامج لوقف زحف الرمال على المزارع والابار والمنشآت – انتاج ذكور حيوانية محسنة - انتاج الاعلاف الحيوانية من المخلفات العضوية – اجراء دراسات الجدوى للمشروعات الزراعية المختلفة فى المناطق الصحراوية – بلاضافة الى عقد دورات تدريبية للمربيين والزراعيين والمستثمرين فى مختلف النشاطات الزراعية فى المناطق الصحراوية .
وهذا قليل من كثير عن مركز بحوث الصحراء والذى اتشرف بالعمل فيه .