قام مركز  الاستزراع السمكي بدراسة إمكانية اســتزراع عدة مشاريع تجريبية منها تجربة استزراع الروبيان الأبيض المحلي حيث أجريت سلسلة من التجارب لمعرفة معدل نموه من خلال تغذيته بنوعين من العلائق أحداهما محلي الصنع والآخر تجاري كما تم القيام بعملية مسح مبدئي لتصنيف موارد المحار ومدى توافره وموسم تكاثره ولتحديد النوع الملائم للاســتزراع والأكثر تكيفا للتغيرات البيئية لمختلف مناطق محافظة مسقط والعوامل المؤثرة على نمو المحاريات كدرجات الحرارة والملوحة .
كما قام مركز  الاستزراع السمكى بالتعاون مع القطاع الخاص بتنفيذ مشروع يعد الأول من نوعه في سلطنة عمان لاستزراع الأسماك الزعنفية بطريقة الأقفاص العائمة في نوفمبر من عام 1996م. كما تم بالتعاون مع خبراء استزراع يابانيين في مجال تنفيذ مشروع استزراع الصفيلح وتعزيز المخزون العام من خلال دراسة إمكانية استزراع الصفيلح العماني في عام (1993/1994م) ودراسة جدوى إنتاج صغار الصفيلح العماني في عام(1996/1997م) كذلك دراسة تطوير إنتاج صغار الصفيلح وتقنيات العناية بها حتى وصولها إلى الحجم التجاري على عدة مراحل في الفترة من (1999 إلى 2008م) .
ولقد كان للنتائج الملموسة لهذه المشاريع قيام المركز بمشروع للدراسات البيئية في المياه العمانية واختيار مواقع الاستزراع السمكي وذلك بهدف إجراء مسح تفصيلي لتحديد المواقع المناسبة للاستزراع السمكي ووضع الضوابط والإرشادات المناسبة لتطوير قطاع الاستزراع السمكي في سلطنة عمان والذي ينبغي إن يكون وفق دراسات متكاملة عن المصادر الطبيعية للأسماك ومدى الحاجة للقيام بالاستزراع السمكي حيث إن اولى اهتمامات السلطنة هي المحافظة على المصادر الطبيعية من التلوث وتوجيه الاهتمام بدرجة كبيرة بالمراقبة البيئية وتأثير مشاريع الاستزراع على المصدر الرئيسي لاسيما الابتعاد عن مواطن التكاثر الطبيعي للأسماك والعناية بمعالجة المياه المستعملة لبعض العناصر التي ينبغي مراقبة مستواها مثل (المركبات النيتروجينية والفوسفورية والمواد الصلبة الذائبة) عند القيام بمشاريع الاستزراع والتي تنتج غالبا من سوء الإدارة أو مستوى التكثيف أو المميزات الطبيعية للبيئة.
أما المشاريع التي يقوم بها المركز حاليا فتتمثل في مشروع تطوير تقنيات تفريخ اسماك الهامور والكوفر كأنواع قابلة للاستزراع السمكي في سلطنة عمان والذي سوف يوفر بيانات مهمة عن تقنيات التفريخ لهذه الأنواع في الظروف المحلية وهو ما سوف يساعد الشركات على الإقبال على هذه الأنواع المحلية والمشروع الأخر هو مشروع دراسة جدوى استزراع خيار البحر الرملي حيث تعدّ ثروة خيار البحر أحد الموارد البحرية الاقتصادية الحديثة في سلطنة عمان والتي امتازت لأهالي ولاية محوت كرصيد آخر بعد ثروة الربيان لتصبح أحد مصادر الرزق الأساسية بالولاية، وبالتالي تزايد الاهتمام في الآونة الأخيرة بصيد خيار البحر لدرجة الاستنزاف ومن أهم أهداف هذا المشروع تحديد موسم تكاثر خيار البحر الرملي العماني والحجم الأدنى للصيد تشجيع الصيادين وتدريبهم على استزراع خيار البحر في البحر