مات الشيخ ابن أبي الوفا المتوفى سنة 814 للهجرة غريقاً في نهر النيل ، وقصة موته عجيبة كما ذكرا لعيني في قصة غرقه هو وأصحابه :

وكانوا اجتمعوا في منظرة على البحر ، ثم اجتمع رأيهم على ركوب بعض المراكب ويتوجهون إلى الآثار ، فامتنع أبو الفضل – ابن أبي الوفا- أشد امتناع فلم يزالوا به حتى ركب معهم ، ولما ركب قال لرفقته : عجباً إن نجونا من الغرق في البحر ؛ فلم يتم كلامه حتى انقلب المركب بهم ، ولم يضفروا بجسده مع التفحص عنه أياماً ، فكأن الأ رض ابتلعته