كانت البداية الأولى لمتحف طنطا في عام 1913 حيث خصصت قاعة في مجلس مدينة طنطا لعرض بعض الآثار .

وفي عام 1957 نقل إلى مدخل سينما البلدية . وفي عام 1981 بدأت هيئة الآثار عملية إنشاء المتحف الحالي الذي جرى افتتاحه في عام 1990 ، تعرض أثار المتحف في أربع طوابق، حيث خصص الطابق الأول للآثار الإسلامية والطابق الثاني للمخطوطات وغيرها .

أما الطابق الثالث فقد خصص لعرض الآثار المصرية في العصرين اليوناني والروماني وكذلك الآثار القبطية . أما الآثار المصرية القديمة فيجري عرضها في الطابق الرابع .

هذا وتمثل بعض الآثار المعروضة نتاج التنقيبات الأثرية التي جرت في المواقع الأثرية بالمحافظة بالإضافة إلى آثار من محافظات ومتاحف أخرى بقصد إثراء المجموعة .