قام الإمام الأكبر د‮. ‬احمد الطيب‮ ‬شيخ الازهر بتهنئة‮  ‬نيافة البابا تواضروس،‮ ‬تليفونيا‮  ‬باختياره علي رأس الكنيسة المرقسية،‮  ‬وتمني شيخ الأزهر له السداد والتوفيق في مهمته الكبيرة التي تنتظره،‮ ‬كما أصدر الإمام الاكبر بيانا قال فيه أن الأزهر الشريف بكل هيئاته ومؤسساته يقدم التهنئة‮  ‬للأخوةَ‮ ‬الأقباط بمناسبة اختيارهم للبابا‮ ‬،‮ ‬مُؤكِّدًا اعتزازه وتقديره لهذا الاختيار،‮ ‬والذي يُعلِّقُ‮ ‬عليه جموع الشعب المصري مسلميه ومسيحييه آمالاً‮ ‬كبيرة في ترسيخ دعائم الوحدة الوطنية التي كثيرًا ما أكَّد عليها البابا الراحل شنودة الثالث‮.‬

ويُؤكِّد الأزهر الشريف علي تعاونه التام مع البابا تواضروس،‮ ‬بما يحقِّقُ‮ ‬مصلحة الوطن العُليا،‮.. ‬كما هنأ فضيلة الدكتور علي جمعة‮ -  ‬مفتي الجمهورية‮ -‬لأنبا تواضروس،‮ ‬وأعرب فضيلة المفتي عن تمنياته بالتوفيق للبابا الجديد الذي سيتحمل المسئولية والعبء خلفاً‮ ‬للبابا شنودة،‮ ‬خاصة أنه سيحمل الراية في تلك الفترة الحرجة والمهمة من تاريخ الوطن‮.‬