فوائد الشمر للجهاز الهضمي يساعد الشمر على تنشيط حركة المعدة والأمعاء ويحفز عصارة المعدة، وبالتالي تسهيل عملية الهضم وسهولة التخلص من الفضلات والانتفاخات والوقاية من الإمساك، كما أنه يعمل على تهدئة المغص عند الأطفالفوائد الشمر لصحة القلب يساعد على خفض نسبة الكوليسترول الضار في الدم وبالتالي الحفاظ على صحة القلب والأوعية الدموية كما يعمل على إذابة الدهون المتراكمة في الجسم والوقاية من خطر الإصابة بالنوبات القلبية وتصلب الشرايينفوائد الشمر لصحة العين يحتوي على الكثير من الفيتامينات والعناصر الهامة للحفاظ على صحة العين وعلاج مشاكل التقدم في العمر مثل الضمور البقعي كما أنه يقلل من إحمرار وانتفاخ العين وحمايتها من الالتهابفوائد الشمر للوقاية من السرطان يحتوي على مضادات الأكسدة وبعض العناصر الهامة التي تساعد على تقوية الجهاز المناعي في الجسم، لذلك فهو يساعد على الوقاية من مرض السرطان خاصةً سرطان الثدي و سرطان الكبدفوائد الشمر للبطن
علاج انتفاخ البطن يشتهر الشمر بأنه مضاد لانتفاخات البطن، وذلك بسبب خصائصه الطاردة للريح بسبب وجود حمض الأسبارتيك، ويمكن استخدام مستلخصات الشمر لكل الأعمار من الرضع إلى كبار السن، كوسيلة للحد من انتفاخ البطن وطرد الغاز الزائد من المعدة، ويستخدم الشمر عادة في الأدوية للحد من أعراض عسر الهضم، وانتفاخ البطن في الرضع والأطفال الصغار. علاج الإسهال الشمر مفيد في علاج الإسهال إذا كان سببه الالتهابات البكتيرية، لأن بعض مكونات الشمر لها خصائص مطهرة ومضادة للجراثيم، كما أن بعض الأحماض الأمينية في الشمر يمكن أن تساعد في الهضم وفي سلامة الجهاز الهضمي، مما يساعد في القضاء على الإسهال بسبب عسر الهضم. علاج الإمساك بذور الشمر، وخاصة في شكل مسحوق، يمكن أن تعمل بمثابة ملين يساعد على تنظيف الأمعاء، في حين أن تأثيره المحفز يساعد في الحفاظ على حركة الأمعاء، الشمر أيضاً شائع في الأدوية التي تعالج آلام البطن، والإسهال، ومتلازمة القولون العصبي، وغيرها من الاضطرابات المعوية..