تعتبر الأعمال الخيرية أيضا ذات أهمية بالنسبة لغيتس وقد أوقف هو وزوجته، مليندا، هبة تفوق 21 بليون دولار لمؤسسة تعمل على دعم مبادرات خيرية في مجالي الصحة والتعليم على إمتداد العالم، بأمل إحراز نجاحات في هذه المجالات الهامة لكل الناس مع الدخول في القرن الحادي والعشرين إلى الآن خصصت مؤسسة بيلومليندا ما يزيد عن 2 بليون دولار لمنظمات تعمل في مجال الصحة العالمية، وأكثر من 500 مليون دولار لتطوير فرص التعليم بما فيه "مبادرة مكتبة غيتس" لتوفير حاسبات آلية، وسبل الوصول للانترنت والتدريب للمكتبات العامة في المجتمعات قليلة الدخل في الولايات المتحدة وكندا، وما يزيد عن 200 مليون دولار لمشاريع مجتمعية في شمال غرب المحيط الهادي، وأكثر من 29 مليون دولار لمشروعات خاصة وحملات سنوية لجمع المال
تزوج غيتس في غرة يناير من عام 1994 بمليندا فرينش، وللزوجين طفلان: بنت، جينيفر كاثرين غيتس، ولدت في 1996، وولد، روي جون غيتس، وولد في 1999، ويعتبر غيتس قارئا نهما، وهو يستمتع بلعب الغولف والبريدج