نظرا لتنوع المفرخات السمكية ، وتباينها فيما بينها ، من حيث المكونات ، وطريقة الانتاج ، والعوامل الفنية والاقتصادية ، التى تؤثر على اقتصادياتها بصفة عامة ، لذا فان تصنيف مشروعات المفرخات السمية يساعد على تقييمها اقتصاديا ، واجتماعيا ، وبيئيا، بشكل أفضل ، بحيث يمكن التمييز بين الكفاءة الاقتصادية ، والمزايا الخاصة بكل نوع منها على حده . وعلى ذلك فانه يمكن تصنيف المفرخات اسمية الى عدة أنواع ، حسب المعايير المستخدمة فى التصنيف، مع الاخذ فى الاعتبار ، أن المفرخ السمكى الواحد قد يندرج تحت أكثر من نوع منها ، فى نفس الوقت ، حسب المعيار المستخدم فى التصنيف – وذلك عل النحو التالى :

أ) التصنف طبقا لدرجة حرارة المياة :

تتنوع المفرخات السمكية طبقا لهذا المعيار حسب درجة حرارة أو ملوحة المياه فى البيئة الطبيعية التى تعيش فيها الأسماك المستخدمة فى التفريغ، وذلك على النحو التالى :

1-التصنيف طبقا لدرجة حرارة المياه:

تنقسم المفرخات السمكية حسب هذا التصنيف الى : مفرخات مياه باردة، مثل مفرخات أسماك السلمون والتراوت،ويوجد هذا النوع من المفرخات فى المناطق الباردة ، بدول أوروبا ، وأمريكا الشمالية ، وشمال أسيا، ومفرخات مياه دافئة مثا مفرخات أسماك البلطى وأسماك المبروك، وهى المفرخات السمكية الشائعة فى جمهورية مصر العربية ، وتوجد بالدول التى تتمتع بمناخ دافىء ، مل المناطق الدافئة بجمهورية الصين.

2- التصنيف طبقا لدرجة ملوحة المياه: 

وطبقا لهذا التصنيف فانه يوجد نوعان من المفرخات السمكية ، هما : مفرخات أسماك المياه العذبة ، مثل مفرخات أسماك البلطى ، والمبروكن وجمبرى المياه العذبة ، ومفرخات الأسماك البحرية ، مثل مفرخات أسماك الدنيس ، والقاروص / وسمك موسى ،ة والجمبرى البحرى.

(ب) التصنيف طبقا لمعيار نوع الأسماك:

تنقسم المفرخات السمكية طبقا لهذا المعيار حسب نوع الأسماك المستخدمة فى التفريغ، مثل مفرخات أسماك البلطى، ومفرخات أسماك الدنيس والقاروص ، ومفرخات جمبرى المياه العذبة، ومفرخات الجمبرى البحرى.

(ج) التصنيف طبقا لمعيار نوع التفريغ:

طبقا لهذا المعيار فان المفرخات السمكية تنسم حسب درجة التدخل الانسانى فى عملية التفريغ الى ثلاثة أنواع ، هى :

1- مفرخات طبيعية تحت السيطرة :

ويتم فيها تكاثر الأسماك بطريقة طبيعية فى أحواض خاصة ، ثم يتم جمع الزريعة الناتجة من عملية التكاثر الطبيعى ، لتحضينها فى أحواض أخرى ، للحصول منها على اصبعيات يتم استخدامها فى الاستزراع السمكى بعد ذلك. وينتشر هذا النوع من المفرخات فى المفرخات الأهلية ،م التى تقوم بتفريخ أسماك البلطى بمصر.

2- مفرخات نصف صناعية :

حيث يتم وضع الذكور والاناث بمعدلات محددة فى أحواض التفريخ، ويتم الحصول عاى البيض المخصب قبل الفقس وخروج الزريعة ، حيث تتم عملية الفقس صناعيا ، بعيدا عن الأمهات حاضنة البيض، مثل بعض مفرخات أسماك البلطى والمبروك.

3- مفرخلت صناعية:

وهى التى يتم فيها استخدام الحث الهرمونى للحصول على البض من الاناث ، والسائل المنوى من الذكور ،ى ثم تتم عملية الاخصاب والفقس ورعاية اليرقات والزريعة صناعيا ، ومن أمثلتها مفرخات أسماك الدنيس والقاروص والمبروك بأنواعه.

(د) التصنيف طبقا لمعيار نوع الحائز:

تنقسم المفرخات السمكية طبقا لهذا المعيار الى : مفرخات حكومية ، تتبع القطاع الحكومى ، مثل مفرخات الهيئة العامة لتنمية الثروة السمكية ، ومفرخات أهلية ، وتشمل كلا من المفرخات التابعة للقطاع الخاص ويحوزها أشخاص حقيقيون ، والمفرخات التابعة للقطاع التعاونى ، وتتبع الجمعيات التعاونية ، كشخصيات اعتبارية.

ه- التصنيف طبقا لمعيار الهدف من المفرخ:

وطبقا لهذا المعيار فان المفرخات السمكية تنقسم الى :

1-مفرخات انتاجية:

وتشتمل على المفرخات الأهلية، التى تقوم بانتاج الزريعة والاصبعيات ، وبيعها للمزارع السمكية ، وبعض المفرخات الحكومية ، التى تهدف الى انتاج الزريعة والاصبعيات لبيعها للمزارع السمكية ، كما يمكن بيعها للمشروعات القومية  ، كانتاج اصبعيات المبروك العادى ، للستزراع السمكى فى حقول الأرز، وانتاج اصبعيات مبروك الحشائش ، للمقاومة الحيوية للحشائش بالترع والمصارف الزراعية ، واصبعيات البلطى والمبروك لتنمية الموارد السمكية الطبيعية.

2- مفرخات ارشادية تدريبية :

وتتبع القطاع الحكومى ، وهى مفرخات عديدة الأهداف ، حيث تقام لأغراض الارشاد ، والتدريب، والانتاج، مثل المفرخات التابعة للهيئة العامة لتنمية الثروة السمكية.

3- مفرخات تجريبية بحثية : 

وهى المفرخات التابعة للجامعات والمعاهد العلمية، والغرض منها هو البحث العلمى ، مثل المفرخات التابعة للمعهد القومى لعلوم البحار والمصايد ، والمفرخات التابعة لجامعة قناة السويس.

     كما توجد معايير أخرى ، يمكن أن تستخدم لتصنيف المفرخات السمكية ، فيمكن تصنيفها – مثلا – طبقا لمعيار نوع الحيازة ، الى مفرخات مملوكة ، ومفرخات مستأجرة ، كما يمكن تصنيفها –أيضا – حسب طبيعة المناخ السائد بالمنطقة التى توجد بها ، حيث تصنف الى مفرخات مناطق باردة ،ومفرخات مناطق حارة ، وهكذا.

ات