الفهرسة علم من العلوم الأساسية في مجال المكتبات والمعلومات، وهو علم له أصوله وقواعده التي استقرت منذ عشرات السنين، ولكنه لا يُكتسب بالقراءة والدراسة فحسب، وإنما بالممارسة العملية. وكما أن السباحة وقيادة السيارات لا تكتسب بالقراءة وإنما بالممارسة فكذلك الفهرسة، لا يكتفى فيها معرفة القواعد أو حفظها واستيعابها، وإنما لابد من تطبيقها على أرض الواقع.
وإذا كان لفهرسة المواد المطبوعة مشاكلها التي تستدعي الاحتكام إلى القواعد، فإن لفهرسة المخطوطات مشاكل أكثر عدداً وأشد تعقيداً، لأن النُّسَخ المتعددة للمخطوط الواحد يتفرد كل منها عن الآخر ويعامل كل منها على أنه كتاب جديد، ولأن فهرسة المخطوطات تتطلب مزيداً من البيانات يفوق ما تتطلبه فهرسة الكتاب المطبوع، واستكمال هذه البيانات يضع المفهرس في مواجهة كثير من التحديات التي قد لا يجد لها حلاًّ في القواعد والتي تحتاج بالضرورة إلى حسّ علمي وخبرة عملية.
للتعامل مع المخطوطات وفهرستها فهرسة تفصيلية. وقد يواجه مفهرس المخطوطات عدداً كبيراً من المشكلات وعليه أن يحاول أن يضع لها حلولاً مع مراعاة توحيد المماراسات في هذا المجال.

فإن " لفهرسة المخطوطات مشكلاتها الجمَّة التي أدت بالباحثين في ميدان التراث إلى الانصراف عن هذا الدرب الوعر الذي هو واحد من أكثر الأعمال مشقة، وأقلها مجداً، ومع ذلك فإن العملية التراثية لا تتم على نحو جاد، إلا إذا ابتدأت بالفهرسة، ونعني بالعملية التراثية هنا: مجموعة الخطوات المتراكبة، المتراتبة، التي تؤدي في النهاية إلى وعي حقيقي بالتراث؛ وهي خطوات: الفهرسة، التحقيق والنشر، الدراسة والبحث " .
ويرجع سبب اهتمامنا بفهرسة وتصنيف المخطوط العربي إلى: " أن تراثنا المخطوط أضخم تراث مخطوط عرفته البشرية لأنه يمتد بطول حقبة من الزمان تربو على أحد عشر قرناً تبدأ منذ عرف العرب الكتب، وتستمر حتى دخول الطباعة في عالمنا العربي مع نهاية القرن الثامن عشر للميلاد، أوائل القرن الثالث عشر للهجرة، وأنه يمتد على رقعة شاسعة من الكرة الأرضية هي تلك التي انتشر فيها الإسلام ومعه لغة القرآن " .
" وأن هذا التراث يمثل حضارة من أرقى الحضارات التي عرفها التاريخ، حضارة استطاعت أن تستوعب حضارات الأمم القديمة وأن تهضمها وتتمثلها وتضيف إليها وتثريها وتخرجها لنا في صورة رائعة كانت أساس النهضة الأوروبية " .
         ولقد مرت عملية فهرسة المخطوطات العربية بمراحل كثيرة، أهمها:
1. البطاقة التي وضعها "توفيق اسكندر "بصفته خبيراً لليونسكو في تونس عام 1965م.
2. البطاقة التي عرضها "صلاح الدين المنجد" في آخر كتابه "قواعد فهرسة المخطوطات العربية".
3. البطاقة التي قدمها " عابد سليمان المشوخي " في كتابه " فهرسة المخطوطات العربية " وقد قدم نموذجين لمستويين من مستويات الفهرسة أحدهما مختصر والآخر مفصل.
4. البطاقة التي أعدها " معهد المخطوطات " التابع لجامعة الدول العربية لفهرسة ما لديه من صور المخطوطات .
5. استمارة فهرسة المخطوطات التي قام بإعدادها "عبد الستار عبد الحق الحلوجي" بناء على تكليف من "مركز المعلومات ودعم اتخاذ القرار" بمصر عام 1997م لفهرسة المخطوطات الموجودة بدار الكتب المصرية ومكتبة الأزهر الشريف والمكتبة المركزية للمخطوطات بوزارة الأوقاف المصرية.
6. البطاقة التي أعدها "مركز توثيق التراث الحضاري والطبيعي" في مؤتمر ذاكرة العالم العربي، في عام 2010م.
وتتصف استمارة "عبد الستار الحلوجي"، التي تتكون من أربع صفحات بالشمول.

ويوجد نوعان من المراجع التي يمكن أن يرجع إليها مفهرس المخطوطات:

1- مراجع يستخدمها عند فهرسة المخطوطات:

1-1- ببليوجرافيات لتوثيق عنوان المخطوط مثل:

1-1-1- حاجي خليفة، مصطفى بن عبد الله. كشف الظنون عن أسامي الكتب و الفنون. بيروت: دار  إحياء التراث العربي، [ د. ت ]. 2 مج. مصورة عن نسخة طبعت بإسطنبول عام 1941 م.

 1-1-2- إسماعيل البغدادي، ابن محمد أمين بن مير سليم الباباني. إيضاح المكنون في الذيل على كشف الظنون عن أسامي الكتب والفنون. بيروت: دار إحياء التراث العربي، [ د. ت ].2 مج. مصورة عن نسخة طبعت باسطنبول عام 1945م.

 1-2- كتب تراجم لتوثيق أسماء المسئولين عن المخطوط مثل:

 1-2-1- إسماعيل البغدادي، ابن محمد أمين بن مير سليم الباباني. هدية العارفين: أسماء المؤلفين والمصنفين. بيروت: دار  إحياء التراث العربي، [ د. ت ]. 2 مج. مصورة عن نسخة طبعت باسطنبول عام 1951 م.

 1-2-2- لزركلي، خير الدين. الأعلام. بيروت: دار العلم للملايين، 1998. 8 مج.

1-2-3- عمر رضا كحالة . معجم المؤلفين . _ بيروت : دار إحياء التراث العربي ، [ د . ت ] . _ 8 مج ؛ 25 سم.

1-2-4- صلاح الدين خليل بن أيبك الصفدي. الوافي بالوفيات. دمشق: المطبعة الهاشمية، 1959. مج1.

2- مراجع لزيادة ثقافة المفهرس:

2-1- أحمد شوقي بنبين.معجم مصطلحات المخطوط العربي ( قاموس كوديكولوجي)/ أحمد شوقي بنبين، مصطفى طوبي. ط 2. مراكش: المطبعة والوراقة الوطنية، 2004. 641 ص.

2-2- أمير محمد صادق إبراهيم. العلامات المائية في المخطوطات العربية: دراسة على مخطوطات مكتبة الأوقاف المصرية/ إشراف عبد الستار عبد الحق الحلوجي. أطروحة ( ماجستير ). جامعة القاهرة، كلية الآداب، قسم المكتبات والوثائق والمعلومات، شعبة المكتبات، 2008. 194ص، 46ص، ملاحق.  

2-3- إياد خالد الطباع. قواعد تحقيق المخطوطات. ص 401 - 489. في. صناعة  المخطوط العربي الإسلامي من الترميم إلى التجليد: الدورة التدريبية الأولى، دبي – الإمارات العربية المتحدة، من 26 ذو الحجة 1417هـ إلى 9محرم 1418هـ الموافق 3مايو 1997م إلى 15مايو 1997م / قدم له ووضع فهارسه عز الدين بن زغيبة. دبي: مركز جمعة الماجد للثقافة والتراث: جامعة الإمارات العربية المتحدة؛ الرباط: المنظمة العربية للتربية والعلوم والثقافة (إيسيسكو)، [1997]. أ-ج، 669 ص.

2-4- أيمن فؤاد سيد. نحو صناعة معجم عربي لمصطلحات المخطوطات. ص 293 – 298. في. التراث العربي: قضايا الحاضر وآفاق المستقبل : بحوث ومداخلات الاجتماعين الثالث والرابع للهيئة المشتركة لخدمة التراث العربي / تنسيق وتحرير فيصل الحفيان. القاهرة: معهد المخطوطات العربية، المنظمة العربية للتربية والثقافة والعلوم، 2002. 373 ص. 

2-5- ـ ـ. الكتاب العربي المخطوط وعلم المخطوطات= Manuscrit Arabe et la Codicologie. القاهرة: الدار المصرية اللبنانية، 1997. 614، 8ص.

2-6- الخوارزمي، أبو عبد الله محمد بن أحمد بن يوسف الكاتب. مفاتيح العلوم. ط2. القاهرة: منشورات مكتبة الكليات الأزهرية،1981. 154ص.

2-7- ديروش،فرانسوا.المدخل إلى علم الكتاب المخطوط بالحرف العربي/ نقله إلى العربية وقدم له أيمن فؤاد سيد. لندن: مؤسسة الفرقان للتراث الإسلامي، 2005. 606ص.

2-8- عابد سليمان المشوخي. فهرسة المخطوطات العربية. ط1. الزرقاء ( الأردن ): مكتبة المنار، 1989. 342ص.

2-9- عبد الرحمن فرفور. قواعد تقييم المخطوطات العربية الإسلامية. ص251 – 345. في. صناعة  المخطوط العربي الإسلامي من الترميم إلى التجليد: الدورة التدريبية الأولى، دبي – الإمارات العربية المتحدة، من 26 ذو الحجة 1417هـ إلى 9محرم 1418هـ الموافق 3مايو 1997م إلى 15مايو 1997م / قدم له ووضع فهارسه عز الدين بن زغيبة. دبي: مركز جمعة الماجد للثقافة والتراث: جامعة الإمارات العربية المتحدة؛ الرباط: المنظمة العربية للتربية والعلوم والثقافة ( إيسيسكو )، [ 1997 ]. أ-ج، 669ص.

2-9- عبد الستار عبد الحق الحلوجي. فهارس المخطوطات: الحلقة الدراسية للخدمات المكتبية والوراقة ( الببليوجرافيا ) والتوثيق والمخطوطات العربية والوثائق القومية. دمشق: وزارة التعليم العالي، 1972. ص 284 – 300.

2-10- ـ ـ. نحو علم مخطوطات عربي. ط1. القاهرة: دار القاهرة، 2004. 213ص.

2-11- ـ ـ. المخطوط العربي. ط1. القاهرة: الدار المصرية اللبنانية، 2002. 334ص.

2-12- ـ ـ. المخطوطات والتراث العربي. ط1. القاهرة: الدار المصرية اللبنانية، 2002. 175ص.

2-13- عصام محمد الشنطي. طرق تأريخ النسخ في المخطوطات: النشأة والحل. تراثيات: مجلة محكمة يصدرها مركز تحقيق التراث بدار الكتب والوثائق القومية. ع4 ( يوليو 2004 ).    ص 9 – 22.

2-14- فاطمة محمد عبد السلام. فهرسة المخطوطات عند الحلوجي بين النظرية والتطبيق. في "في المخطوطات والتراث: دراسات مهداة إلى الأستاذ الدكتور عبد الستار الحَلوَجِّي بمناسبة بلوغه سن السبعين (1938 – 2008م)"/ تقديم كمال عرفات نبهان. القاهرة: مكتبة الإمام البخاري، 2008. 416ص. ص 226 - 227.

2-15- محمد حلمي إبراهيم. فهرسة المخطوطات العربية بين النظرية والتطبيق: تجربة مكتبة الأوقاف المصرية/ إعداد محمد حلمي إبراهيم، أحمد بهجت أحمد، ياسمين حسن محمد؛ تقديم ومراجعة عبد الستار عبد الحق الحلوجي. ـ الإسماعيلية (مصر): مكتبة الإمام البخاري، 2012. ـ 216 ص؛ 24 سم.

2-16- محمد فتحي عبد الهادي. تصنيف المخطوطات. ص 157. في " فن فهرسة المخطوطات: مدخل وقضايا. في " ندوة قضايا المخطوطات (2) خلال ( 27، 28 سبتمبر 1998 ) " / تنسيق وتحرير فيصل الحفيان. القاهرة: معهد المخطوطات العربية، المنظمة العربية للتربية والثقافة والعلوم، 1999. 336 ص.

2-17- محمد عبد العزيز محمد القاضي. المخطوطات في مؤسسات وزارة الأوقاف المصرية دراسة نظرية وتطبيقيةفي ضوء مشروع المكتبة المركزية للمخطوطات/ إشراف عبد الستار عبد الحق الحلوجي؛ ومشاركة  شمس الأصيل محمد علي. أطروحة (ماجستير) -جامعة القاهرة- كلية الآداب- قسم المكتبات والوثائق والمعلومات، 2010. 140ص.

2-18- محمود محمد الطناحي. ثقافة المفهرس. ص 191 - 192. في " فن فهرسة المخطوطات: مدخل وقضايا " في "ندوة قضايا المخطوطات (2) خلال ( 27، 28 سبتمبر 1998 ) " / تنسيق وتحرير فيصل الحفيان. القاهرة: معهد المخطوطات العربية، المنظمة العربية للتربية والثقافة والعلوم، 1999. 336 ص.

2-19- ناصر منصور إبراهيم الكلاوي. فنون تجليد الكتب في العصر العثماني في ضوء المجموعات الأثرية بمدينة القاهرة: دراسة فنية أثرية / إشراف محمود إبراهيم حسين. أطروحة (ماجستير) -جامعة القاهرة- كلية الآثار- قسم الآثار الإسلامية، 2008.. 2مج.

2-20- وسف زيدان. مشكلات توثيق العنوان والمؤلف، ص 117- 135 في: " فن فهرسة المخطوطات: مدخل وقضايا"." في "ندوة قضايا المخطوطات (2) خلال ( 27، 28سبتمبر 1998 )" / تنسيق وتحرير فيصل الحفيان.القاهرة: معهد المخطوطات العربية، المنظمة العربية للتربية والثقافة والعلوم، 1999. 336ص. ص117 ".